质疑中南大学基础医学院副教授黄河学术不端
本人由于想投稿一篇中文论文,搜索了几个生命科学领域的核心期刊,每个下载几篇论文看看水平,结果在《生命科学研究》杂志发现一篇题为《条件性敲除APC 基因小鼠肠道腺瘤模型的构建》的论文存在造假嫌疑。
该论文摘要说“肠道条件性敲除APC基因后, 小鼠的表型并不清楚”。其实,之前的在肠道条件型敲除 APC 的报道很多,比如“A new conditional Apc-mutant mouse model for colorectal cancer. Carcinogenesis, 2010”,有趣的是,该文使用的小鼠在“Complete deletion of Apc results in severe polyposis in mice. Oncogene, 2010”中首次报道(这篇文章被附在 Jax Lab 网站该品系小鼠说明的后面),那篇文章同样用了Villin-Cre,该中文文章却声称未被人报道过。而 他使用的实验数据也和这篇2010年的 paper 类似,没什么新意可说。这显然不诚实。
在“实验动物”部分,写到“在APC基因第15个外显子插入loxP序列的Apcfx/fx小鼠 (strain name: C57BL/6-Apctm1Tyj/J, 美国The Jackson Laboratory)”(该小鼠 Jax Stock Num. 009045) 。这么说很不准确,因为Cre作用至少需要两个 loxP 位点。而他所给出的这个小鼠是在第一个外显子之前和第15个外显子之后各插入一个 loxP 位点。Jackson Lab在小鼠 “Detailed Discription” 里面写的很清楚,原文是:“The 15 coding exons are flanked by loxP sites”,是15个,不是第15个。在“Development”部分更详细的介绍为“loxP-flanked puromycin resistance cassette was introduced to an intron 5’ of the first coding exon. In vitro Cre-mediated recombination was used to excise the floxed region, leaving a single loxP site. Genomic regions 3’ of the gene were then targeted with a loxP-FRT-neomycin-FRT cassette. In vivo germline FLPe-mediated recombination was done to excise the neomycin resistance gene leaving loxP and FRT sites 3’ of the gene. ”小鼠Apc 基因的 ORF一共15个外显子,第15个外显子包含大部分ORF区,APC条件性敲除小鼠很多是将两个 loxP 位点分别放在 第15 或者 第14 个外显子两侧,而作者使用的这个小鼠品系则是将两个loxP直接放在了全部15个外显子两侧。该文章对实验材料不清不楚,写作很随意。
3.该文章中说“将Villin-Cre 小鼠和APC-fl/fl小鼠合笼得到VillinCre;APCfl/+小鼠;有意思的是后者进一步与APCfl/fl小鼠合笼,却没有得到VillinCre;APCfl/fl小鼠” Jax Lab 的提供的鉴定方法里面(就是这篇中文paper给出的PCR鉴定方法),有一个 Note : This assay cannot distinguish heterozygous from homozygous animals. Jax Lab 还写了 “Heterozygote/Homozygote= 471 bp & 341 bp, Wild type = 341 bp”, 就是说纯合子和杂合子都是两条带,即该PCR根本鉴定不出来APC fx/fx纯合子。所以,该问的作者们可能直接忽视了卖给他们小鼠的 Jax Lab 的这一重要说明,想当然的以为可以鉴定出纯合子,从而得出了不能得出的不恰当结论。(当然,我并没有查询肠道条件型敲除APC会不会胚胎期致死,可能会,也可能不会)
- 鉴于第3点,我质疑该文章中的 图1 的小鼠鉴定结果有造假嫌疑。图1 APC 鉴定结果里面的 第4泳道,图注说明基因型是 APC fx/fx,但出现只有 471bp 条带的情况是不可能的。显然,这个泳道有很明显的 Photoshop 处理抹掉条带的痕迹。涉嫌对结果造假。
本人不认识作者本人,之前也没有听说过,但看到这样发表论文,作为同行,实在是痛心,忍不住举报。 请对举报人身份保密。
Lackson Lab : https://www.jax.org/jax-mice-and-services 文中所用小鼠:https://www.jax.org/strain/009045 涉嫌造假论文见附件。
(XYS20170920)